Biraj Shrestha estudiante del doctorado en Biología Cuantitativa en la Universidad de Texas en Arlington, realizó una estancia en la FES Zaragoza este verano para aprender y utilizar técnicas de secuenciación genómica de ADN que realizan en el Laboratorio de Sistemática Molecular, a cargo del doctor Uri Omar García Vázquez.
Biraj estudia las relaciones evolutivas de anfibios y reptiles, su trabajo se enfoca en la genética de poblaciones en mesoamérica. Actualmente investiga un grupo de lagartijas arbóreas del género Sceloporus, que se distribuyen desde el centro de México hasta Centroamérica en zonas montañosas.
Para venir a México, antes extrajo ADN de muestras de tejidos de los ejemplares con los que cuenta la Universidad de Texas, y buscó el apoyo de la FES Zaragoza para realizar secuenciación genómica y así, dar un vistazo en la evolución y variación genética de las poblaciones de estas lagartijas.
Se trata de unas lagartijas verdes que viven sobre todo en bosques de pino y encino, en bosques templados, aunque también hay en bosques tropicales, están sobre todo en México pero llegan hasta Costa Rica.
Biraj busca definir cuántas especies hay dentro de ese grupo, partiendo de que hay cerca de nueve descritas; su investigación permitirá incluso conocer qué factores históricos promovieron la separación de las especies como alguna barrera ecológica o geológica.
La técnica empleada en la FES Zaragoza que particularmente interesaba al doctorante Biraj, es la técnica de secuenciación genómica conocida como Radseq “lo que hacemos es usar unas enzimas de restricción que producen algunas bacterias, estas enzimas lo que hacen es cortar todo el ADN en sitios muy específicos… entonces al final lo que nosotros tenemos son fragmentos de todo el genoma de diferentes tamaños”, explicó el doctor García Vázquez.
El Laboratorio de Sistemática Molecular de la FESZ se dedica principalmente a delimitar especies y analizar patrones evolutivos. La técnica de Radseq “nos permite juntar en un solo tubo (biblioteca) fragmentos de ADN de múltiples, que fueron previamente marcados para después de secuenciar poder distinguirlos, nosotros en cada biblioteca secuenciamos cerca de 290 ejemplares, esta tecnica nos permite tener representado todo el genoma. Antes de eso trabajábamos con dos o tres genes muy específicos, generalmente mitocondriales, ahora ya tenemos evidencia de otros tipos de genes de diferentes regiones de todo el genoma”, abundó.
Ésta es la primera vez que un estudiante extranjero de doctorado realiza trabajo en el laboratorio, “hemos tenido alumnos de diversas partes del mundo que vienen a revisar la colección o ejemplares bajo el microscopio, por ejemplo de Smithsoniano y del museo Americano de Historia Natural”, explicó el doctor Uri Vázquez
Tras la visita, Biraj considera que la UNAM y en particular la FESZ, cuenta con grandes laboratorios de biología molecular, “pude ver que el laboratorio está muy bien equipado, con material y personas bien capacitadas”.
Tras terminar su doctorado, Biraj planea estudiar un post doctorado, hacer más investigación, sumar más experiencia y luego regresar a Nepal.
